|
|
Bioluminiscence obrněnek
Zahradníček, Ondřej ; Němcová, Yvonne (vedoucí práce) ; Pichrtová, Martina (oponent)
Bioluminiscence je v přírodě poměrně rozšířeným jevem. Schopnost vyzařovat světlo má celá řada organismů. Cílem této bakalářské práce je shrnutí nejnovějších poznatků týkajících se bioluminiscence u obrněnek. Tyto organismy představují nejdůležitější protistní linii schopnou produkovat světelné záblesky. Jsou totiž zodpovědné za většinu bioluminiscence pozorované v povrchových mořích a oceánech. Bakalářská práce podrobně popisuje biochemickou reakci bioluminiscence, při které dochází k oxidaci substrátu (luciferinu) za přítomnosti enzymu luciferázy. V práci jsou představeny nejvýznamnější druhy světélkujících obrněnek, které často způsobují i toxické vodní květy. Následně se práce dotýká faktorů ovlivňujících intenzitu bioluminiscence. V neposlední řadě je v práci zmíněno, jak mohou obrněnky využít bioluminiscenci jako ochranu proti predátorům. Zábleskem světla mohou např. vylekat predátory nebo záblesk použijí jako "poplašný systém", kterým přilákají predátory svých predátorů. Klíčová slova: bioluminiscence, luciferin, luciferáza, obrněnka, záblesk světla
|
|
|
Dynamika degradace hodinového proteinu PER2 pomocí detekce bioluminiscence v reálném čase ve tkáňovém explantátu cirkadiánních hodin mPER2Luc myši
Stanislavová, Faustýna ; Sumová, Alena (vedoucí práce) ; Doležel, David (oponent)
Hlavním oscilátorem cirkadiánních rytmů jsou suprachiasmatická jádra. Pomocí hodinových genů a jejich proteinových produktů (tvořících zpětnovazebné transkripčně- translační smyčky) představují významnou roli v řízení mnoha tělesných funkcích. Díky metodě využívající transgenní organismy byla měřena bioluminiscence, potažmo množství hodinového proteinu PER2. V této práci byl využit cykloheximid k inhibici proteosyntézy a k následnému sledování degradace tohoto hodinového proteinu v reálném čase. Protein byl měřen v explantátech suprachiasmatických jader dospělých myší, v suprachiasmatických jádrech fétů a v placentách. Dále byly porovnávány vlivy inhibitorů glykogensyntasykinasy 3b na dynamiku degradace proteinu PER2. Využit byl selektivní inhibitor CHIR-99021 a nespecifický inhibitor chlorid lithný. Z experimentu vyplývá, že inhibitor CHIR degradaci proteinu zpomaluje, a to ve všech použitých tkáních. Oproti tomu vliv nespecifického inhibitoru chloridu lithného nebyl jednoznačně určen. U fetálních jader byl jeho vliv na dynamiku degradace zpomalující, zatímco u dospělých jader byla degradace výrazně zrychlována. U explantátů placent nebyly pozorovány signifikantní výsledky. Výzkumy, zaměřující se na ovlivnění těchto hodinových genů, resp. jejich proteinů, by v budoucnu mohly být využity k...
|
|
|
Metody sledování buněčných procesů v reálném čase
Švecová, Iva ; Hodný, Zdeněk (vedoucí práce) ; Groušl, Tomáš (oponent)
Cílem této práce je poskytnout přehled metod využívaných ke sledování procesů v živých buňkách v reálném čase se zaměřením na sledování signálních drah. První, neobsáhlejší část práce se zabývá metodami využívajícími fluorescenci, poté se zmíníme také o bioluminiscenčních metodách a metodách nevyžadujících značení. V sekci o fluorescenčních metodách si nejprve představíme typy fluoroforů a příslušné způsoby značení. Následně se podíváme na jednotlivé přístupy. Začneme dvěma způsoby designu biosenzorů, následovat budou tři metody umožňující sledování kinetiky molekul, poté se seznámíme s metodou FLIM využívanou ke sledování prostředí kolem fluoroforu a skončíme s dvěma technikami vylepšujícími rozlišení. U každé techniky si vysvětlíme její princip a uvedeme si příklady využití. Na závěr se podíváme na příklad sledování signální dráhy.
|
|
|
Využití bioluminiscenčních, histologických a imunohistochemických technik při studiu lokalizace produktů genové exprese v tkáních hmyzu
PAUCHOVÁ, Lucie
Reportérovými geny běžně užívanými v molekulární biologii jsou geny enzymů katalyzující bioluminiscenční reakce. Tyto genové markery se uplatňují zejména při studiu oscilace genových produktů v centrálním oscilátoru cirkadiánních hodin. Tato práce zdokonalila techniku, pomocí které lze sledovat změnu exprese cirkadiánního genu period na úrovni jednoho neuronu v mozku Drosophila melanogaster, využitím bioluminiscenčních markerů. Kromě toho byla práce zaměřena na lokalizaci nově identifikovaného neuropeptidu TEFLa v různých vývojových stádiích ploštice Pyrrhocoris apterus. Tento neuropeptid byl detekován v mozcích nymf i dospělců, v posteriorní části středního střeva dospělců a v gonádách larev. U embryí byl nalezen v oblasti okrajů uzavírajícího se amnionového obalu. Syntéza TEFLa neuropeptidu ve střevě dospělců je kontrolována cirkadiánními rytmy. Zjištění distribuce tohoto peptidu je prvním krokem ke specifikaci jeho funkce.
|
|
|
Sample preparation for single cell analysis
Adamová, Eva ; Basova, E. Y. ; Potáčová, Anna ; Foret, František ; Matalová, Eva ; Klepárník, Karel
Development of sensitive, miniaturized and fast methods aims to reliable analyze even small amounts of samples. Micromanipulation systems such as laser capture microdissection enable to collect just single cells from cell suspensions or tissue samples. One option for further analysis is the bioluminescence reaction based on luciferin/luciferase conversion. This approach was used for detection of active caspases, caspase-3/7. Droplets based microfluidic systems provide benefits in biological, pharmaceutical and chemical research.
|
|
| |
|
|
Optical Fiber Element of Sensors with Biolumiscent Cells
Vrbová, Hana ; Kuncová, Gabriela ; Pospíšilová, Marie
In this work, we compared theoretical calculations [2] of coupling efficiency with experiments for various OFEs with the immobilized whole-cell bacterial bioreporter of Pseudomonas fluorescens HK44 (producing bioluminescence in presence of naphthalene and salicylate). We evaluated the influence of the physical properties and geometry of the OFE, active layer and cell immobilization techniques on intensity of detected light.
|
|
| |
host ::
RSS.